Bereits seit 2007 wird das Colegio de las Aguas vom Bildungsministerium der Stadt Cali unterstützt, um Kindern und Jugendlichen aus der Gemeinde Montebello den Schulbesuch zu ermöglichen. Dank der pädagogischen Qualität im Unterricht wurde diese Unterstützung bis heute fortgesetzt.
Das Ministerium führt regelmäßig Prüfungen durch, um festzustellen, ob die privaten Schulen, wie das Colegio de las Aguas, weiterhin unterstützt werden. In den Prüfungen werden die Kategorien finanzielle Verwaltung, Pädagogik und Infrastruktur untersucht. Dafür erfolgen jeweils bis zu vier Besuche der Schule und zum Ende des Jahres wird anhand der Ergebnisse ein Plan für das kommende Jahr aufgestellt.
Im akademischen Bereich konnte sich die Schule in den letzten Jahren im Rahmen der SABER-Prüfungen stets verbessern. Dabei liegt der Fokus auf Mathematik und Spanisch in der fünften und neunten Klasse. In der Gegend um Montebello wurde im Bereich der Grundschule der beste Wert erreicht.
Im Gesamtergebnis des Schulministeriums müssen mindestens 35 Punkte erreicht werden. In diesem Jahr steht die Schule bei 51. Für das nächste Jahr sind unter anderem Verbesserungen der Klassenräume vorgesehen und ein Fokus liegt auf der Ausstattung des IT-Raums, für den Montebellos Kinder e.V. zurzeit Spenden sammelt.